Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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