Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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