Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE2

Trbv3, T cell receptor beta, variable 3 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv3A0A0A6YYE2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv3A0A0A6YYE2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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