Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B633

Trav8n-2, T cell receptor alpha variable 8n-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8n-2A0A075B633 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trav8n-2A0A075B633 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav8n-2A0A075B633 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trav8n-2A0A075B633 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trav8n-2A0A075B633 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav8n-2A0A075B633 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trav8n-2A0A075B633 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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