Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Y3

Ighv1-80, Immunoglobulin heavy variable 1-80 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-80A0A075B5Y3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms