Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5W3

Ighv1-53, Immunoglobulin heavy variable 1-53 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-53A0A075B5W3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-53A0A075B5W3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ighv1-53A0A075B5W3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ighv1-53A0A075B5W3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ighv1-53A0A075B5W3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ighv1-53A0A075B5W3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ighv1-53A0A075B5W3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ighv1-53A0A075B5W3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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