Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Smg9Q9DB90 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Smg9Q9DB90 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Smg9Q9DB90 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Smg9Q9DB90 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Smg9Q9DB90 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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