Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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