Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm22490-201ENSMUST00000157188 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms