Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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PtpreP49446 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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PtpreP49446 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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PtpreP49446 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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PtpreP49446 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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PtpreP49446 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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PtpreP49446 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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PtpreP49446 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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PtpreP49446 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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PtpreP49446 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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PtpreP49446 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtpreP49446 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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