Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxa10P31310 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa10P31310 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms