Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RxraP28700 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RxraP28700 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RxraP28700 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RxraP28700 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RxraP28700 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RxraP28700 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RxraP28700 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RxraP28700 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
RxraP28700 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms