Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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