Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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