Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11490-201ENSMUST00000118128 272 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms