Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim35Q8C006 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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