Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm10287-202ENSMUST00000180599 4059 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc18Q640L5 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms