Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
VdrP48281 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
VdrP48281 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
VdrP48281 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
VdrP48281 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
VdrP48281 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
VdrP48281 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
VdrP48281 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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VdrP48281 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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