Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Sh3bp2Q06649 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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Sh3bp2Q06649 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Sh3bp2Q06649 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Sh3bp2Q06649 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Sh3bp2Q06649 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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Sh3bp2Q06649 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms