Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ggta1P23336 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ggta1P23336 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ggta1P23336 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Ggta1P23336 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Ggta1P23336 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm25606-201ENSMUST00000158363 95 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
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Ggta1P23336 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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Ggta1P23336 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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Ggta1P23336 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
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Ggta1P23336 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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Ggta1P23336 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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Ggta1P23336 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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Ggta1P23336 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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Ggta1P23336 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm4788-203ENSMUST00000111989 3187 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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Ggta1P23336 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ggta1P23336 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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