Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms