Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TtrP07309 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TtrP07309 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TtrP07309 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms