Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms