Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd13P70217 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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