Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtpreP49446 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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PtpreP49446 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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PtpreP49446 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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