Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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PdgfaP20033 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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PdgfaP20033 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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PdgfaP20033 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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PdgfaP20033 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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PdgfaP20033 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PdgfaP20033 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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