Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Rabgef1Q9JM13 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Rabgef1Q9JM13 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Rabgef1Q9JM13 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Rabgef1Q9JM13 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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