Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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Usp48Q3V0C5 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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Usp48Q3V0C5 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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Usp48Q3V0C5 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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Usp48Q3V0C5 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Usp48Q3V0C5 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Usp48Q3V0C5 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Usp48Q3V0C5 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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