Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms