Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Rnf40Q3U319 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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Rnf40Q3U319 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Rnf40Q3U319 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Rnf40Q3U319 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Rnf40Q3U319 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Rnf40Q3U319 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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Rnf40Q3U319 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Rnf40Q3U319 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Rnf40Q3U319 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Rnf40Q3U319 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Rnf40Q3U319 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Rnf40Q3U319 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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Rnf40Q3U319 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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