Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr1009-203ENSMUST00000216443 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm23256-201ENSMUST00000102235 110 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Sh3bp1P55194 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Sh3bp1P55194 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Sh3bp1P55194 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
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