Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Brpf1B2RRD7 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms