Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms