Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Cntn3Q07409 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Cntn3Q07409 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Cntn3Q07409 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Cntn3Q07409 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Cntn3Q07409 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Cntn3Q07409 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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