Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Sh3bp2Q06649 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Sh3bp2Q06649 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Sh3bp2Q06649 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Sh3bp2Q06649 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
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Sh3bp2Q06649 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Sh3bp2Q06649 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Sh3bp2Q06649 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Sh3bp2Q06649 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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