Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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