Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm29038-201ENSMUST00000191543 678 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RxraP28700 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RxraP28700 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RxraP28700 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RxraP28700 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RxraP28700 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RxraP28700 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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