Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms