Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm28339-201ENSMUST00000185845 696 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm28828-201ENSMUST00000186601 696 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm28896-201ENSMUST00000188609 696 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm29186-201ENSMUST00000189178 660 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm28159-201ENSMUST00000190296 696 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm38107-201ENSMUST00000194873 696 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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Col5a3Q9JLI2 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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Col5a3Q9JLI2 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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Col5a3Q9JLI2 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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Col5a3Q9JLI2 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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Col5a3Q9JLI2 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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Col5a3Q9JLI2 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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Col5a3Q9JLI2 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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Col5a3Q9JLI2 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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Col5a3Q9JLI2 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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Col5a3Q9JLI2 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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