Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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