Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Prdm6Q3UZD5 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Prdm6Q3UZD5 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Prdm6Q3UZD5 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Prdm6Q3UZD5 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Prdm6Q3UZD5 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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