Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Usp39Q3TIX9 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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Usp39Q3TIX9 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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Usp39Q3TIX9 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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Usp39Q3TIX9 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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Usp39Q3TIX9 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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