Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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