Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpraP18052 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpraP18052 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms