Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Spink1-201ENSMUST00000025381 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr105-ps-202ENSMUST00000215518 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r19-201ENSMUST00000073948 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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