Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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