Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Trim35Q8C006 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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Trim35Q8C006 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Trim35Q8C006 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Trim35Q8C006 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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Trim35Q8C006 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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