Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Vmn1r174-202ENSMUST00000228331 9058 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr393-202ENSMUST00000213365 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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