Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TtrP07309 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm24739-201ENSMUST00000158855 292 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Vmn1r71-208ENSMUST00000228374 3717 ntAPPRIS P2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TtrP07309 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm23319-201ENSMUST00000104467 131 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms