Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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Ccl20O89093 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Vmn1r80-202ENSMUST00000227205 10892 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
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Ccl20O89093 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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Ccl20O89093 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
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Ccl20O89093 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
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Ccl20O89093 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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Ccl20O89093 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm3646-201ENSMUST00000171319 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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